新冠病毒傳播初期已高度適應人類 需高度警惕二次暴發(fā)
流行早期至中期的SARS-CoV、流行晚期的SARS-CoV以及2020年1月至3月的SARS-CoV-2樣本中S蛋白等基因的dN和dS對比情況
這些研究結(jié)果意味著,
SARS-CoV-2在暴發(fā)之初就已經(jīng)高度適應于人類,并表現(xiàn)出極強的傳播能力。
研究人員還表示,在人類和動物中,一種更早期的、適應性較差的共同祖病毒尚未被找到,其前體或分支也是缺失的。這表明該病毒以一種高人類適應性的形式進入人類社會,這也意味著在不久的將來再次出現(xiàn)SARS-CoV-2的風險較高,且其后果可能較嚴重。
自然界進化可能使新冠病毒與多物種結(jié)合,應擴大采樣范圍
迄今為止,研究人員仍不確定新冠病毒的中間宿主是什么。此前的研究發(fā)現(xiàn),與SARS-CoV-2關(guān)系最密切的冠狀病毒是蝙蝠冠狀病毒RaTG13,而從馬來西亞穿山甲中分離出的一種冠狀病毒的遺傳序列與SARS-CoV-2有高達91%的同源性,因此,研究人員認為,就目前而言,蝙蝠是新冠病毒起源、穿山甲是中間宿主的可能性較大。
此外,研究人員指出,新冠病毒的S蛋白有可能在蝙蝠或多種中間宿主中自然進化出其廣泛的物種向性,即它可能與多物種的受體結(jié)合。
此前有研究預測,SARS-CoV-2的S蛋白可能與100多種不同物種的ACE2(血管緊張素轉(zhuǎn)化酶2,新冠病毒的人類受體)結(jié)合,并且比SARS-CoV對于蝙蝠和人類ACE2的結(jié)合性都強。
因此,盡管尚未發(fā)現(xiàn)蝙蝠冠狀病毒具有SARS-CoV-2樣的S蛋白RBD(受體結(jié)合域),但新冠病毒很可能在自然界中進化,并且可以以最佳水平與不同物種的同一受體結(jié)合。研究人員建議,
應從更多物種中進行冠狀病毒采樣,從而更好地掌握攜帶與SARS-CoV-2相似的RBD的冠狀病毒的物種范圍,明確其中間宿主。
為了尋找有關(guān)新冠病毒中間宿主的線索,研究人員還分析了有關(guān)SARS-CoV-2如何進化和適應人類傳播的最新發(fā)現(xiàn),并研究了武漢華南海鮮市場的環(huán)境樣本。
結(jié)果表明,2020年1月份在市場發(fā)現(xiàn)的病毒分離株不太可能起源于中間動物宿主,而是最有可能來自被SARS-CoV-2感染的人,他們可能是市場里的賣家或顧客。